Tumefacţia cutanată este de obicei simetrică şi evoluează spre induraţie. Poate fi localizată doar la nivelul degetelor (sclerodactilie) şi mainii sau poate afecta cea mai mare parte sau toate tegumentele. Pielea poate devein intinsă, lucioasă şi hipo sau hiper pigmentată; faţa devine asemenea unei măşti. La nivelul degetelor, toracelor, fetei, buzelor şi inimii pot apărea telangiectazii. Calcificarile subcutanate apar mai ales la nivelul pulpei degetelor şi al proeminentelor osoase. Ulcerele trofice sunt obişnuite mai ales la nivelul pulpei degetelor, deasupra articulaţiilor falaginene sau al nodulilor calcari.
Implicarea tractului gastrointestinal este extrem de frecventă în sclerodermie, putând fi implicat orice segment al tractului gastrointestinal, cel mai frecvent esofagul. Manifestările digestive sunt secundare afectării microvascularizaţiei (ce determină subţierea mucoasei şi secundar ulceraţii) şi atrofiei şi fibrozei musculaturii netede (responsabile de tulburările de motilitate).
Hipomotilitatea intestinului subţire are ca efect imnulţirea excesivă a bacteriilor anaerobe , ceea ce poate conduce la malabsorbţie. Gazele pot penetra peretele intestinal afectat, fiind vizibile radiologic.
Ciroza biliară poate aparea in cazul pacientului cu sindrom CREST (calcinoza cutanată, fenomen Raynaud, dismorfism esofagian, sclerodactilie, telangiectazii) – sclerodermie cutanată limitată.
Afectarea pulmonară apare la majoritatea pacienţilor cu sclerodermie şi este principala cauză de mortalitate, clinic manifestându-se prin dispnee progresivă, tuse seacă. Cele mai frecvente complicaţii pulmonare sunt fibroza pulmonară interstiţială şi hipertensiunea arteriala pulmonară, la mulţi pacienţi putânf fi prezente ambele procese.. Pot apare pericardita cu acumulare de lichid pericardic sau pleurezie. Artimiile cardiace sunt obişnuite in astfel de cazuri.
Afectarea renală severă, adesea brusc instalată, poate surveni in primii 4 – 5 ani de evoluţie, la pacienţii cu sclorodermie difuză.